Além de usar o menu de contexto, também é possível marcar um arquivo para ser apagado através de linha de comando ou soltando-o no ícone do Boot Deleter.
Para poder usar o Boot Deleter, é necessário integrá-lo ao Windows Explorer, o que pode ser facilmente feito através da interface do programa.
Então, basta clicar com o botão direito do mouse sobre um arquivo e marcá-lo para que o sistema o apague antes do Windows inicializar.
Para remover esta integração, basta executar o programa e clicar em “Remove from Windows Shell”.
Para usar o programa através de linha de comando, então use a sintaxe “Boot Deleter.exe” [nome do arquivo].[extensão].
Para apagar um arquivo totalmente, sem nenhum tipo de confirmação, use a sintaxe “Boot Deleter.exe” DELETE [nome do arquivo].[extensão].